Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmigd3G3X8R9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmigd3G3X8R9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmigd3G3X8R9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmigd3G3X8R9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmigd3G3X8R9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmigd3G3X8R9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmigd3G3X8R9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmigd3G3X8R9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmigd3G3X8R9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tmigd3G3X8R9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tmigd3G3X8R9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tmigd3G3X8R9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmigd3G3X8R9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms