Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r167G3UW71 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r167G3UW71 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r167G3UW71 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r167G3UW71 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r167G3UW71 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r167G3UW71 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r167G3UW71 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r167G3UW71 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r167G3UW71 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r167G3UW71 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r167G3UW71 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r167G3UW71 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r167G3UW71 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r167G3UW71 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r167G3UW71 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r167G3UW71 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r167G3UW71 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r167G3UW71 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r167G3UW71 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms