Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
5830473C10RikF8VQ07 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
5830473C10RikF8VQ07 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms