Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Speer4aF8VPX6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Speer4aF8VPX6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms