Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm28048F7BCN0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm28048F7BCN0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm28048F7BCN0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm28048F7BCN0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm28048F7BCN0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms