Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm8220F6YKI2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.9 ms