Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5861F6VCN9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5861F6VCN9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5861F6VCN9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5861F6VCN9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm5861F6VCN9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5861F6VCN9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm5861F6VCN9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms