Protein–RNA interactions for Protein: F6S0S7

E130114P18Rik, RIKEN cDNA E130114P18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130114P18RikF6S0S7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E130114P18RikF6S0S7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms