Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TrdnE9Q9K5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TrdnE9Q9K5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.5 ms