Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms