Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Ryr1E9PZQ0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ryr1E9PZQ0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms