Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Trappc8E9PWG2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Trappc8E9PWG2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Trappc8E9PWG2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Trappc8E9PWG2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Trappc8E9PWG2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Trappc8E9PWG2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Trappc8E9PWG2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Trappc8E9PWG2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Trappc8E9PWG2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Trappc8E9PWG2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Trappc8E9PWG2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Trappc8E9PWG2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Trappc8E9PWG2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Trappc8E9PWG2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Trappc8E9PWG2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Trappc8E9PWG2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Trappc8E9PWG2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Trappc8E9PWG2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Trappc8E9PWG2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Trappc8E9PWG2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Trappc8E9PWG2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Trappc8E9PWG2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Trappc8E9PWG2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Trappc8E9PWG2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Trappc8E9PWG2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Trappc8E9PWG2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Trappc8E9PWG2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Trappc8E9PWG2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Trappc8E9PWG2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Trappc8E9PWG2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Trappc8E9PWG2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Trappc8E9PWG2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Trappc8E9PWG2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Trappc8E9PWG2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
Trappc8E9PWG2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Trappc8E9PWG2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Trappc8E9PWG2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Trappc8E9PWG2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Trappc8E9PWG2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Trappc8E9PWG2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Trappc8E9PWG2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Trappc8E9PWG2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Trappc8E9PWG2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Trappc8E9PWG2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Trappc8E9PWG2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Trappc8E9PWG2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Trappc8E9PWG2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Trappc8E9PWG2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Trappc8E9PWG2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Trappc8E9PWG2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Trappc8E9PWG2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Trappc8E9PWG2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Trappc8E9PWG2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Trappc8E9PWG2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Trappc8E9PWG2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Trappc8E9PWG2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Trappc8E9PWG2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Trappc8E9PWG2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Trappc8E9PWG2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Trappc8E9PWG2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Trappc8E9PWG2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Trappc8E9PWG2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Trappc8E9PWG2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms