Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Trim12cD3Z3L3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim12cD3Z3L3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms