Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clip3B9EHT4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clip3B9EHT4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clip3B9EHT4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clip3B9EHT4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip3B9EHT4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip3B9EHT4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms