Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Scn7aB1AYL1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Scn7aB1AYL1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Scn7aB1AYL1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scn7aB1AYL1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scn7aB1AYL1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scn7aB1AYL1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scn7aB1AYL1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scn7aB1AYL1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scn7aB1AYL1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Scn7aB1AYL1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scn7aB1AYL1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scn7aB1AYL1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Scn7aB1AYL1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scn7aB1AYL1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scn7aB1AYL1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scn7aB1AYL1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scn7aB1AYL1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Scn7aB1AYL1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scn7aB1AYL1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scn7aB1AYL1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scn7aB1AYL1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scn7aB1AYL1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scn7aB1AYL1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scn7aB1AYL1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms