Protein–RNA interactions for Protein: A7KBS4

Zscan4d, Zinc finger and SCAN domain containing protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4dA7KBS4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zscan4dA7KBS4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zscan4dA7KBS4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Zscan4dA7KBS4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zscan4dA7KBS4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zscan4dA7KBS4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zscan4dA7KBS4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zscan4dA7KBS4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zscan4dA7KBS4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zscan4dA7KBS4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zscan4dA7KBS4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zscan4dA7KBS4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zscan4dA7KBS4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zscan4dA7KBS4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zscan4dA7KBS4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zscan4dA7KBS4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zscan4dA7KBS4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zscan4dA7KBS4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zscan4dA7KBS4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zscan4dA7KBS4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Zscan4dA7KBS4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zscan4dA7KBS4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zscan4dA7KBS4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zscan4dA7KBS4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zscan4dA7KBS4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms