Protein–RNA interactions for Protein: A6H6S0

Herc3, Hect domain and RLD 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3A6H6S0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Herc3A6H6S0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Herc3A6H6S0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms