Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CatsperbA2RTF1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CatsperbA2RTF1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms