Protein–RNA interactions for Protein: A2ALK8

Ptpn3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn3A2ALK8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ptpn3A2ALK8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpn3A2ALK8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms