Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930447F04RikA2AFR2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.5 ms