Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisal2aA2A9G7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms