Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Prdm2A2A7B5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Prdm2A2A7B5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Prdm2A2A7B5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Prdm2A2A7B5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Prdm2A2A7B5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Prdm2A2A7B5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Prdm2A2A7B5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Prdm2A2A7B5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Prdm2A2A7B5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Prdm2A2A7B5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Prdm2A2A7B5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Prdm2A2A7B5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Prdm2A2A7B5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Prdm2A2A7B5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Prdm2A2A7B5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Prdm2A2A7B5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Prdm2A2A7B5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Prdm2A2A7B5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Prdm2A2A7B5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Prdm2A2A7B5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Prdm2A2A7B5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Prdm2A2A7B5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Prdm2A2A7B5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Prdm2A2A7B5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Prdm2A2A7B5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Prdm2A2A7B5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Prdm2A2A7B5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Prdm2A2A7B5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Prdm2A2A7B5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Prdm2A2A7B5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Prdm2A2A7B5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Prdm2A2A7B5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Prdm2A2A7B5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Prdm2A2A7B5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Prdm2A2A7B5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Prdm2A2A7B5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Prdm2A2A7B5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms