Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933424G06RikA0A140LIP3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms