Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Mbd3Q9Z2D8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Mbd3Q9Z2D8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Mbd3Q9Z2D8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mbd3Q9Z2D8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mbd3Q9Z2D8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mbd3Q9Z2D8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mbd3Q9Z2D8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mbd3Q9Z2D8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mbd3Q9Z2D8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Mbd3Q9Z2D8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mbd3Q9Z2D8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mbd3Q9Z2D8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mbd3Q9Z2D8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mbd3Q9Z2D8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mbd3Q9Z2D8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mbd3Q9Z2D8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mbd3Q9Z2D8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mbd3Q9Z2D8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mbd3Q9Z2D8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mbd3Q9Z2D8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mbd3Q9Z2D8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mbd3Q9Z2D8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mbd3Q9Z2D8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mbd3Q9Z2D8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mbd3Q9Z2D8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mbd3Q9Z2D8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Mbd3Q9Z2D8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Mbd3Q9Z2D8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mbd3Q9Z2D8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mbd3Q9Z2D8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mbd3Q9Z2D8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mbd3Q9Z2D8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mbd3Q9Z2D8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mbd3Q9Z2D8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mbd3Q9Z2D8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mbd3Q9Z2D8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mbd3Q9Z2D8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mbd3Q9Z2D8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Mbd3Q9Z2D8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mbd3Q9Z2D8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mbd3Q9Z2D8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mbd3Q9Z2D8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mbd3Q9Z2D8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mbd3Q9Z2D8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mbd3Q9Z2D8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mbd3Q9Z2D8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mbd3Q9Z2D8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mbd3Q9Z2D8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mbd3Q9Z2D8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mbd3Q9Z2D8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mbd3Q9Z2D8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mbd3Q9Z2D8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mbd3Q9Z2D8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms