Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NfkbiaQ9Z1E3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfkbiaQ9Z1E3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms