Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Shcbp1Q9Z179 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Shcbp1Q9Z179 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms