Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Apobec2Q9WV35 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apobec2Q9WV35 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms