Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trpv2Q9WTR1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpv2Q9WTR1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trpv2Q9WTR1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpv2Q9WTR1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpv2Q9WTR1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpv2Q9WTR1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms