Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NrkQ9R0G8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NrkQ9R0G8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NrkQ9R0G8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NrkQ9R0G8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NrkQ9R0G8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NrkQ9R0G8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NrkQ9R0G8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NrkQ9R0G8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NrkQ9R0G8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
NrkQ9R0G8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NrkQ9R0G8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NrkQ9R0G8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NrkQ9R0G8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NrkQ9R0G8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NrkQ9R0G8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NrkQ9R0G8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NrkQ9R0G8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NrkQ9R0G8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NrkQ9R0G8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NrkQ9R0G8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NrkQ9R0G8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NrkQ9R0G8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
NrkQ9R0G8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NrkQ9R0G8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NrkQ9R0G8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NrkQ9R0G8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NrkQ9R0G8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
NrkQ9R0G8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
NrkQ9R0G8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.11
NrkQ9R0G8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NrkQ9R0G8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NrkQ9R0G8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
NrkQ9R0G8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NrkQ9R0G8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NrkQ9R0G8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NrkQ9R0G8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
NrkQ9R0G8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NrkQ9R0G8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
NrkQ9R0G8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NrkQ9R0G8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NrkQ9R0G8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NrkQ9R0G8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NrkQ9R0G8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NrkQ9R0G8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NrkQ9R0G8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NrkQ9R0G8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NrkQ9R0G8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NrkQ9R0G8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NrkQ9R0G8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NrkQ9R0G8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NrkQ9R0G8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
NrkQ9R0G8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
NrkQ9R0G8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NrkQ9R0G8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NrkQ9R0G8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NrkQ9R0G8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NrkQ9R0G8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
NrkQ9R0G8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NrkQ9R0G8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NrkQ9R0G8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NrkQ9R0G8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NrkQ9R0G8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NrkQ9R0G8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NrkQ9R0G8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NrkQ9R0G8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NrkQ9R0G8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
NrkQ9R0G8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NrkQ9R0G8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NrkQ9R0G8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NrkQ9R0G8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NrkQ9R0G8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
NrkQ9R0G8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NrkQ9R0G8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NrkQ9R0G8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NrkQ9R0G8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NrkQ9R0G8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NrkQ9R0G8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NrkQ9R0G8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
NrkQ9R0G8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NrkQ9R0G8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NrkQ9R0G8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
NrkQ9R0G8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NrkQ9R0G8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NrkQ9R0G8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NrkQ9R0G8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NrkQ9R0G8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NrkQ9R0G8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NrkQ9R0G8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NrkQ9R0G8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NrkQ9R0G8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NrkQ9R0G8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NrkQ9R0G8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NrkQ9R0G8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NrkQ9R0G8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NrkQ9R0G8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NrkQ9R0G8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NrkQ9R0G8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NrkQ9R0G8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NrkQ9R0G8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms