Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc3Q9QZC1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms