Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Six6Q9QZ28 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms