Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Plxnb3Q9QY40 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Plxnb3Q9QY40 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Plxnb3Q9QY40 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Plxnb3Q9QY40 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Plxnb3Q9QY40 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Plxnb3Q9QY40 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Plxnb3Q9QY40 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Plxnb3Q9QY40 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Plxnb3Q9QY40 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Plxnb3Q9QY40 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Plxnb3Q9QY40 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Plxnb3Q9QY40 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Plxnb3Q9QY40 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Plxnb3Q9QY40 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Plxnb3Q9QY40 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Plxnb3Q9QY40 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Plxnb3Q9QY40 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Plxnb3Q9QY40 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Plxnb3Q9QY40 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Plxnb3Q9QY40 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Plxnb3Q9QY40 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Plxnb3Q9QY40 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Plxnb3Q9QY40 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Plxnb3Q9QY40 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Plxnb3Q9QY40 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms