Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nufip1Q9QXX8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nufip1Q9QXX8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nufip1Q9QXX8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nufip1Q9QXX8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nufip1Q9QXX8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nufip1Q9QXX8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nufip1Q9QXX8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nufip1Q9QXX8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nufip1Q9QXX8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nufip1Q9QXX8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nufip1Q9QXX8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nufip1Q9QXX8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nufip1Q9QXX8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nufip1Q9QXX8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Nufip1Q9QXX8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nufip1Q9QXX8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nufip1Q9QXX8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nufip1Q9QXX8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nufip1Q9QXX8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nufip1Q9QXX8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nufip1Q9QXX8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nufip1Q9QXX8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nufip1Q9QXX8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nufip1Q9QXX8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nufip1Q9QXX8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms