Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms