Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Rai2Q9QVY8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms