Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms