Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM4

Slamf1, Signaling lymphocytic activation molecule, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slamf1Q9QUM4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slamf1Q9QUM4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slamf1Q9QUM4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slamf1Q9QUM4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slamf1Q9QUM4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slamf1Q9QUM4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slamf1Q9QUM4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Slamf1Q9QUM4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slamf1Q9QUM4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slamf1Q9QUM4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slamf1Q9QUM4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slamf1Q9QUM4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slamf1Q9QUM4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slamf1Q9QUM4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slamf1Q9QUM4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slamf1Q9QUM4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slamf1Q9QUM4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slamf1Q9QUM4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slamf1Q9QUM4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slamf1Q9QUM4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slamf1Q9QUM4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slamf1Q9QUM4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms