Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH6

Txnrd1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnrd1Q9JMH6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Txnrd1Q9JMH6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Txnrd1Q9JMH6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Txnrd1Q9JMH6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Txnrd1Q9JMH6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Txnrd1Q9JMH6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Txnrd1Q9JMH6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Txnrd1Q9JMH6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Txnrd1Q9JMH6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Txnrd1Q9JMH6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Txnrd1Q9JMH6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Txnrd1Q9JMH6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Txnrd1Q9JMH6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Txnrd1Q9JMH6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Txnrd1Q9JMH6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Txnrd1Q9JMH6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Txnrd1Q9JMH6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Txnrd1Q9JMH6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Txnrd1Q9JMH6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Txnrd1Q9JMH6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Txnrd1Q9JMH6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Txnrd1Q9JMH6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Txnrd1Q9JMH6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Txnrd1Q9JMH6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Txnrd1Q9JMH6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Txnrd1Q9JMH6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Txnrd1Q9JMH6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Txnrd1Q9JMH6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Txnrd1Q9JMH6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Txnrd1Q9JMH6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Txnrd1Q9JMH6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Txnrd1Q9JMH6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms