Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sfmbt1Q9JMD1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms