Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col5a3Q9JLI2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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