Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SacsQ9JLC8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SacsQ9JLC8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SacsQ9JLC8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SacsQ9JLC8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SacsQ9JLC8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SacsQ9JLC8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SacsQ9JLC8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SacsQ9JLC8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SacsQ9JLC8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SacsQ9JLC8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SacsQ9JLC8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SacsQ9JLC8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SacsQ9JLC8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SacsQ9JLC8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SacsQ9JLC8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SacsQ9JLC8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SacsQ9JLC8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SacsQ9JLC8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SacsQ9JLC8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SacsQ9JLC8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SacsQ9JLC8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SacsQ9JLC8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SacsQ9JLC8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SacsQ9JLC8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SacsQ9JLC8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SacsQ9JLC8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SacsQ9JLC8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SacsQ9JLC8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 536.5 ms