Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CtsmQ9JL96 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms