Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hmgn5Q9JL35 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmgn5Q9JL35 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hmgn5Q9JL35 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hmgn5Q9JL35 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Hmgn5Q9JL35 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hmgn5Q9JL35 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hmgn5Q9JL35 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hmgn5Q9JL35 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Hmgn5Q9JL35 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hmgn5Q9JL35 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hmgn5Q9JL35 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hmgn5Q9JL35 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hmgn5Q9JL35 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hmgn5Q9JL35 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmgn5Q9JL35 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmgn5Q9JL35 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmgn5Q9JL35 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms