Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Bco1Q9JJS6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Bco1Q9JJS6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Bco1Q9JJS6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bco1Q9JJS6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bco1Q9JJS6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bco1Q9JJS6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Bco1Q9JJS6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bco1Q9JJS6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Bco1Q9JJS6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Bco1Q9JJS6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bco1Q9JJS6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bco1Q9JJS6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bco1Q9JJS6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bco1Q9JJS6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bco1Q9JJS6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bco1Q9JJS6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Bco1Q9JJS6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Bco1Q9JJS6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bco1Q9JJS6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Bco1Q9JJS6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Bco1Q9JJS6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bco1Q9JJS6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Bco1Q9JJS6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bco1Q9JJS6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bco1Q9JJS6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bco1Q9JJS6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bco1Q9JJS6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bco1Q9JJS6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bco1Q9JJS6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bco1Q9JJS6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bco1Q9JJS6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bco1Q9JJS6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bco1Q9JJS6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bco1Q9JJS6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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