Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ush1cQ9ES64 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ush1cQ9ES64 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ush1cQ9ES64 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ush1cQ9ES64 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ush1cQ9ES64 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ush1cQ9ES64 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ush1cQ9ES64 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ush1cQ9ES64 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ush1cQ9ES64 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ush1cQ9ES64 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ush1cQ9ES64 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ush1cQ9ES64 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ush1cQ9ES64 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ush1cQ9ES64 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ush1cQ9ES64 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ush1cQ9ES64 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ush1cQ9ES64 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ush1cQ9ES64 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ush1cQ9ES64 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ush1cQ9ES64 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ush1cQ9ES64 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ush1cQ9ES64 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ush1cQ9ES64 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms