Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Clstn2Q9ER65 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Clstn2Q9ER65 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Clstn2Q9ER65 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Clstn2Q9ER65 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Clstn2Q9ER65 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Clstn2Q9ER65 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Clstn2Q9ER65 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Clstn2Q9ER65 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Clstn2Q9ER65 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Clstn2Q9ER65 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Clstn2Q9ER65 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Clstn2Q9ER65 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Clstn2Q9ER65 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Clstn2Q9ER65 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Clstn2Q9ER65 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Clstn2Q9ER65 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Clstn2Q9ER65 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Clstn2Q9ER65 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Clstn2Q9ER65 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Clstn2Q9ER65 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Clstn2Q9ER65 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Clstn2Q9ER65 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Clstn2Q9ER65 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Clstn2Q9ER65 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Clstn2Q9ER65 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Clstn2Q9ER65 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Clstn2Q9ER65 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Clstn2Q9ER65 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Clstn2Q9ER65 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Clstn2Q9ER65 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Clstn2Q9ER65 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Clstn2Q9ER65 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Clstn2Q9ER65 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Clstn2Q9ER65 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Clstn2Q9ER65 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Clstn2Q9ER65 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Clstn2Q9ER65 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Clstn2Q9ER65 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Clstn2Q9ER65 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Clstn2Q9ER65 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Clstn2Q9ER65 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Clstn2Q9ER65 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Clstn2Q9ER65 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Clstn2Q9ER65 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Clstn2Q9ER65 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Clstn2Q9ER65 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Clstn2Q9ER65 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Clstn2Q9ER65 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Clstn2Q9ER65 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Clstn2Q9ER65 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Clstn2Q9ER65 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Clstn2Q9ER65 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Clstn2Q9ER65 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Clstn2Q9ER65 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Clstn2Q9ER65 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Clstn2Q9ER65 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Clstn2Q9ER65 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Clstn2Q9ER65 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Clstn2Q9ER65 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Clstn2Q9ER65 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Clstn2Q9ER65 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Clstn2Q9ER65 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Clstn2Q9ER65 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Clstn2Q9ER65 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Clstn2Q9ER65 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Clstn2Q9ER65 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Clstn2Q9ER65 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Clstn2Q9ER65 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Clstn2Q9ER65 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Clstn2Q9ER65 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Clstn2Q9ER65 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Clstn2Q9ER65 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Clstn2Q9ER65 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Clstn2Q9ER65 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Clstn2Q9ER65 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Clstn2Q9ER65 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Clstn2Q9ER65 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Clstn2Q9ER65 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Clstn2Q9ER65 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Clstn2Q9ER65 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Clstn2Q9ER65 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Clstn2Q9ER65 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Clstn2Q9ER65 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Clstn2Q9ER65 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Clstn2Q9ER65 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Clstn2Q9ER65 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Clstn2Q9ER65 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Clstn2Q9ER65 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Clstn2Q9ER65 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Clstn2Q9ER65 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Clstn2Q9ER65 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Clstn2Q9ER65 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Clstn2Q9ER65 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Clstn2Q9ER65 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Clstn2Q9ER65 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Clstn2Q9ER65 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Clstn2Q9ER65 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Clstn2Q9ER65 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Clstn2Q9ER65 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms