Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM3

Nkx2-4, Homeobox protein Nkx-2.4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-4Q9EQM3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-4Q9EQM3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-4Q9EQM3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-4Q9EQM3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-4Q9EQM3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-4Q9EQM3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-4Q9EQM3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-4Q9EQM3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx2-4Q9EQM3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx2-4Q9EQM3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx2-4Q9EQM3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-4Q9EQM3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx2-4Q9EQM3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx2-4Q9EQM3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx2-4Q9EQM3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx2-4Q9EQM3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx2-4Q9EQM3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-4Q9EQM3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-4Q9EQM3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-4Q9EQM3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-4Q9EQM3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-4Q9EQM3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-4Q9EQM3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-4Q9EQM3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-4Q9EQM3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-4Q9EQM3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-4Q9EQM3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-4Q9EQM3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-4Q9EQM3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-4Q9EQM3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-4Q9EQM3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx2-4Q9EQM3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx2-4Q9EQM3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx2-4Q9EQM3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-4Q9EQM3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-4Q9EQM3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-4Q9EQM3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-4Q9EQM3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-4Q9EQM3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-4Q9EQM3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-4Q9EQM3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-4Q9EQM3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx2-4Q9EQM3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx2-4Q9EQM3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx2-4Q9EQM3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx2-4Q9EQM3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx2-4Q9EQM3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx2-4Q9EQM3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx2-4Q9EQM3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx2-4Q9EQM3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx2-4Q9EQM3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx2-4Q9EQM3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx2-4Q9EQM3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx2-4Q9EQM3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx2-4Q9EQM3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx2-4Q9EQM3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx2-4Q9EQM3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx2-4Q9EQM3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx2-4Q9EQM3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx2-4Q9EQM3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx2-4Q9EQM3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.5 ms