Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xab2Q9DCD2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms