Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Xrn2Q9DBR1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Xrn2Q9DBR1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Xrn2Q9DBR1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Xrn2Q9DBR1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Xrn2Q9DBR1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Xrn2Q9DBR1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Xrn2Q9DBR1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Xrn2Q9DBR1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Xrn2Q9DBR1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Xrn2Q9DBR1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xrn2Q9DBR1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xrn2Q9DBR1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xrn2Q9DBR1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xrn2Q9DBR1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xrn2Q9DBR1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Xrn2Q9DBR1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xrn2Q9DBR1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrn2Q9DBR1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrn2Q9DBR1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrn2Q9DBR1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrn2Q9DBR1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrn2Q9DBR1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrn2Q9DBR1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrn2Q9DBR1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrn2Q9DBR1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrn2Q9DBR1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrn2Q9DBR1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrn2Q9DBR1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrn2Q9DBR1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrn2Q9DBR1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrn2Q9DBR1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrn2Q9DBR1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrn2Q9DBR1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrn2Q9DBR1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xrn2Q9DBR1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrn2Q9DBR1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrn2Q9DBR1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrn2Q9DBR1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrn2Q9DBR1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Xrn2Q9DBR1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Xrn2Q9DBR1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Xrn2Q9DBR1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Xrn2Q9DBR1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Xrn2Q9DBR1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Xrn2Q9DBR1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Xrn2Q9DBR1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Xrn2Q9DBR1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xrn2Q9DBR1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xrn2Q9DBR1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xrn2Q9DBR1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xrn2Q9DBR1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Xrn2Q9DBR1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xrn2Q9DBR1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xrn2Q9DBR1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xrn2Q9DBR1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xrn2Q9DBR1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xrn2Q9DBR1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xrn2Q9DBR1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xrn2Q9DBR1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xrn2Q9DBR1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xrn2Q9DBR1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xrn2Q9DBR1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xrn2Q9DBR1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xrn2Q9DBR1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xrn2Q9DBR1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xrn2Q9DBR1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xrn2Q9DBR1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms