Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU9

Znf654, Zinc finger protein 654, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf654Q9DAU9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf654Q9DAU9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf654Q9DAU9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Znf654Q9DAU9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Znf654Q9DAU9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf654Q9DAU9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf654Q9DAU9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf654Q9DAU9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf654Q9DAU9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf654Q9DAU9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf654Q9DAU9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf654Q9DAU9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf654Q9DAU9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf654Q9DAU9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf654Q9DAU9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf654Q9DAU9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf654Q9DAU9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf654Q9DAU9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf654Q9DAU9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf654Q9DAU9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms